猪链球菌裂解酶PlyGBS1249的结构域功能分析开题报告

 2023-02-15 10:31:18

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

1.研究意义1.1猪链球菌和猪链球菌病猪链球菌(streptococcus suis)是一种重要的人畜共患病病原菌,能引起猪的败血症、脑膜炎、肺炎、多发性关节炎和多发性装膜炎等;该菌在特定情况下也能感染人,引起人的急性败血症、脑膜炎、心内膜炎等疾病[1]。

猪链球菌病呈世界性分布。

目前,美国、荷兰、英国、加拿大、澳大利亚、新西兰、比利时、巴西、丹麦、挪威、芬兰、西班牙、德国、爱尔兰、中国(包括大陆、香港和台湾)、日本等几乎所有养猪国家和地区均有发生猪链球菌病的报道,这不仅给养猪业造成了巨大的经济损失,同时还对公共卫生尤其是相关从业人员的健康构成严重威胁[2]。

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2. 研究的基本内容和问题

1.研究目标1.1表达和纯化猪链球菌裂解酶三个结构域蛋白,并进行特性分析(包括酶学性质分析、裂解谱的构建、电镜观察)1.2对裂解酶细胞壁结构域的功能进行分析,获得关键氨基酸位点。

2.研究内容2.1裂解酶各个结构域的表达与纯化针对裂解酶各个功能结构域(酶活结构域、细胞壁结合结构域)的序列的orf设计表达引物,使用高保真dna聚合酶扩增片段,用双酶切法,只保留c端组氨酸标签(试验证实n端组氨酸标签干扰裂解酶的酶活性区域的正确折叠,导致重组裂解酶失去抑菌活性),连接至pet或含有gfp蛋白的质粒,转化至大肠杆菌感受态细胞中进行表达。

将采用低iptg浓度和低温等诱导表达方式,尽可能地使目的蛋白有活性地表达在上清中。

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3. 研究的方法与方案

1.研究方法及可行性分析构建重组质粒、目的蛋白克隆表达与检测、构建裂解谱、裂解酶细胞壁结构域的功能分析。

导师课题组自上世纪九十年代起就开始专注于链球菌的研究,具备细菌病原的分离鉴定、蛋白表达纯化以及免疫血清学检测等各方面技术条件。

同时还拥有蛋白组学分析平台和生物信息学分析平台,已系统地对猪链球菌(s. suis)、无乳链球菌(s. agalactiae)、鸭疫里氏杆菌(riemerella anatipestifer)、禽源大肠杆菌(e. coli)等重要的动物细菌病病原进行了蛋白组学分析,具有扎实的实验基础。

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4. 研究创新点

1.在项目设计方面,不是重复以往的工作,而是以导师课题组前期工作为基础,以酶学性质分析和裂解谱试验确定裂解酶的各个功能结构域的作用,进行横向比较,避免了不同条件下所表达的目的蛋白的差异性对裂解效果的影响。

2.本项目选题,切合了我国猪链球菌病急需防治的实际需求,同时有较强的针对性和公共卫生学意义。

此外,猪链球菌病的防治主要依赖于抗生素,而抗生素的使用会发生药物残留,导致食品安全等一系列严重问题,本项目选题从实际出发,通过对裂解酶不同功能结构域的研究,为猪链球菌病的防治提供新的途径。

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5. 研究计划与进展

第一阶段(2017.92017.10)学习实验室操作规范,完善实验设计、熟悉相关操作。

第二阶段(2017.112017.12)完成针对裂解酶各个功能结构域(酶活结构域、细胞壁结合结构域)的序列的orf设计表达引物,诱导表达,使目的蛋白尽可能表达在上清中,使用sds-page检测纯化效果。

第三阶段(2018.22018.5) 确定是何种结构域起最为重要的作用,确定重组蛋白的最佳使用浓度、最适温度、最适ph值。

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