1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
日本沼虾,学名日本沼虾(macrobrachium nipponense),隶属于十足目、长臂虾科、沼虾属,是我国重要的淡水经济虾类品种。
日本沼虾主要生活在淡水水域,以淡水湖、河、池、沼中为主,在我国各地均有分布,但主养区主要集中在江苏、上海、浙江、安徽、江西等省份。
据2013年《中国渔业年鉴》公布,2012年日本沼虾养殖产量23.7万吨,养殖面积约40万公顷,日本沼虾养殖业年产值约200亿元,是我国水产养殖业的重要组成部分。
2. 研究的基本内容和问题
研究目标,初步分析β-葡萄糖苷酶23基因在日本沼虾中的功能。
以采购于无锡太湖边的野生太湖日本沼虾为原材料,以促雄腺为模板,对β-葡萄糖苷酶23克隆,并利用生物信息分析的相关软件对其特征进行分析,最后通过在日本沼虾不同组织(精巢、卵巢、促雄腺、眼柄等组织)进行定量表达分析,从而初步分析其在日本沼虾中的功能,确定其是否为性别相关基因。
拟解决的关键问题:1.β-葡萄糖苷酶23基因cdna全长的克隆;2.通过分析β-葡萄糖苷酶23基因在日本沼虾不同组织中的表达量,初步分析其在日本沼虾中的功能。
3. 研究的方法与方案
1. 研究方法:(1)将实验用虾进行促雄腺总rna的提取,并对总rna的质量进行分析;(2)合成促雄腺总rna第一链cdna的模板,对β-glucosidase 23基因中间序列进行pcr扩增,将pcr产物切胶回收并克隆测序,验证中间片段正确性;(3)合成3race和5race模板,对β-glucosidase 23基因进行cdna序列全长克隆以及序列分析;(4)对β-glucosidase 23基因在日本沼虾不同组织中进行定量表达研究。
2. 技术路线(见附件)3. 可行性分析:本实验所需实验条件成熟。
且采样团队经验丰富,所用实验的日本沼虾来源正规、体格标准。
4. 研究创新点
关于β-葡萄糖苷酶的研究目前主要在植物以及微生物方面,此次在日本沼虾上做β-葡萄糖苷酶23的克隆和表达分析,如果能够成功,为首次在水产动物对该基因进行克隆及表达研究。
且如果分析得出此基因为性别相关基因,可极大推动日本沼虾全雄群体培育,经济价值及应用前景广泛。
5. 研究计划与进展
9月末,对实验相关理论知识的学习补充,对实验器材、试剂等的认识,对分子生物学实验流程的跟踪学习10月至11月初,实验样本促雄腺总RNA的提取,提取的总RNA浓度的测定以及质量检测,促雄腺总RNA第一链cDNA的合成11月末至12月末,β-glucosidase 23基因中间序列的获得和验证,.PCR产物切胶回收并克隆测1月初,β-glucosidase 23基因cDNA序列全长克隆2月末至3月,β-glucosidase 23基因不同组织的定量表达研究4月,整理数据,撰写毕业论文
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