猪ACTA2基因突变对脂肪性状的相关性研究开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

意义：

目前，随着生活水平的不断提高和改善，越来越多的人开始追求高品质的饮食。猪肉是日常生活的主要副食品，是人们餐桌上重要的动物性食品之一，其品质也备受消费者的关注。目前对猪肉品质评价指标主要有感官指标和加工技术指标等，感官指标包括猪肉的嫩度、颜色和风味物质，加工技术指标包括猪肉的持水力、ph值和肌内脂肪含量^[1]。脂肪性状是猪肉品质的一项重要指标，是食用品质的决定因素，直接关系到肉的嫩度、风味和多汁性。影响猪脂肪性状的因素很多，其中遗传因素起决定性作用^[2]。所以，改良猪的脂肪性状不仅对改善肉质有很重要的影响，还对猪的育种工作也有很重要的意义。

肌动蛋白α2(actin alpha 2, acta2)是高度保守的蛋白质，是肌纤维母细胞的细胞表型可靠标志性蛋白，参与细胞的运动，维持结构的完整性和进行细胞间信号的传导。其编码的蛋白质是平滑肌肌动蛋白，参与血管的收缩和血压稳态。目前对于acta2的研究很少，特别是其对脂肪性状的影响研究是少之又少。仅有研究表明acta2 与猪的肌内脂肪相关显著。

2. 研究的基本内容和问题

研究目标：

对猪的acta2氨基酸和mrna序列进行一系列生物信息学分析，同时根据猪背膘厚分析高低组中acta2基因的表达水平，研究acta2基因对脂肪的影响机制，为进一步研究猪acta2基因的功能奠定基础。

研究内容：

3. 研究的方法与方案

研究方法:

通过美国国家生物信息中心（ncbi，nationalcenter for biotechnology information）(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)获取猪的acta2蛋白质序列和mrna序列，对猪应用生物信息学的方法对猪acta2蛋白进行了基因结构域、特异序列、蛋白质结构等基因特征分析，提取背最长肌rna，之后进行反转录反应，设计acta2基因的引物，利用实时荧光定量pcr（qpcr）技术进行扩增效率检测，之后通过qpcr检测acta2基因在背膘厚高低组中的表达量，整理和分析数据，获取猪等几种物种acta2基因的信息比对结果及acta2基因与脂肪组织的关系

实验方案：

应用生物信息学方法对猪acta2基因进行一系列生物信息分析，提取背最长肌rna，使用反转录试剂盒进行cdna第一链的合成。应用primer3.0plus软件并与ncbi网站上primer-blast相结合设计acta2基因特异性引物，并由上海生物工程公司合成。通过实时荧光定量pcr对acta2基因表达进行分析，使用统计软件对数据进行分析。

4. 研究创新点

本项目是通过研究猪ACTA2基因的生物信息分析及其对脂肪性状的相关性，来分析ACTA2基因与脂肪发育的内在机制，目前对此方面的研究分析较为有限。

5. 研究计划与进展

2018年12月-2019年1月 查阅文献资料、熟悉实验操作

2019年1月-2019年4月 设计引物进行实时荧光定量pcr

2019年4月-2019年5月 对试验数据进行统计分析

2019年5月-2019年6月 撰写论文