1. 研究目的与意义（文献综述包含参考文献）
1.d-丙氨酸-d-丙氨酸连接酶的简介d-丙氨酸-d-丙氨酸连接酶可以催化两分子d-丙氨酸缩合为一分子d-丙氨酰-d-丙氨酸二肽。
该二肽在d-丙氨酸添加酶murf的催化下连接到胞壁酸上[1]，胞壁酸是合成肽聚糖的前体，肽聚糖是细胞壁的主要成分，因此d-丙氨酸-d-丙氨酸连接酶对细胞物理结构的稳定至关重要[2]。
酶的atp结合超家族共同拥有一个称为atp结合折叠的非典型核苷酸结合位点。
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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案
本课题首先要利用autodock建立嗜热栖热菌d-丙氨酸-d-丙氨酸连接酶与底物d-丙氨酸的复合物模型，并借此获得活性中心的位置和周围氨基酸残基的相关信息。
同时通过ncbi的blast功能获取相似序列并通过比对分析得出可能的突变位点。
最后通过rosetta输出对接构象，分析筛选所得构象，确保其符合嗜热栖热菌d-丙氨酸-d-丙氨酸连接酶的催化机制并且能量尽可能低（结构稳定），筛选出的构象即为实验结果。
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