1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
研究意义：
植物组织生长发育的各阶段都有相应的组织特异性基因在调控，也有看家基因维持着植物的生命活动。植物的不同组织有着相同的基因型，而表观遗传学的修饰以及机制是调控组织特异性基因表达的重要方式，研究这个有助于了解组织特异性基因的作用原理.
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2. 研究的基本内容和问题
研究内容：
本课题以水稻根、叶、愈伤组织为研究材料，运用rna-seq方法，结合二代测序技术探索水稻在三个组织中的基因表达差异，建立标准筛选出组织特异性基因与持家基因。此外，运用chip-seq方法，鉴定水稻在三个组织中的组织特异性与持家基因所在位置的核小体组蛋白修饰及开放性染色质位点变化等表观特征。通过生物信息学及关联分析，预测筛选出的组织特异性与组成型表达基因在表观修饰上的特征和差异。
目标：
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3. 研究的方法与方案
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4. 研究创新点
特色或创新之处
1.自建组织特异性与组成型表达标准，极大地缩小了统计检验的范围。
2.利用rna-seq数据筛选基因基础上，运用chip-seq数据对相应基因座进行了表观遗传学特征的研究。
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5. 研究计划与进展
2018.11-2018.12 rnaseq数据处理，得到表达数据
2019.01-2019.02 建立标准筛选组织特异性基因与看家基因
2019.03 针对筛选出的基因的chip-seq测序数据分析表观修饰
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